G-protein coupled receptor expression patterns delineate medulloblastoma subgroups

Whittier, Kelsey L; Boese, Erin A; Gibson-Corley, Katherine N; Kirby, Patricia A; Darbro, Benjamin W; Qian, Qining; Ingram, Wendy J; Robertson, Thomas; Remke, Marc; Taylor, Michael D; O’Dorisio, M Sue

doi:10.1186/2051-5960-1-66

Acta Neuropathologica Communications

Table 1 GPCR expression levels by linkage analysis clusters, compared to normal cerebella

From: G-protein coupled receptor expression patterns delineate medulloblastoma subgroups

	Cluster “A”		Cluster “B”		Cluster “C”		Cluster “D”		Cluster E”
	(n = 7)		(n = 4)		(n = 10)		(n = 4)		(n = 14)
	Fold change	p-value	Fold change	p-value	Fold change	p-value	Fold change	p-value	Fold change	p-value
FZD2	25	0.01	27	0.04	16	0.01	45	0.01	4.5	0.05
RPLP0	15	0.01	7.8	0.32	9.8	0.01	28	0.01	2.9	0.19
EDG4	25	0.01	22	0.04	22	0.01	20	0.03	7.8	0.04
PTGER4	14	0.01	2.0	0.43	5.7	0.01	2.9	0.30	1.1	0.90
GPR126	17	0.01	13	0.21	15	0.01	0.67	0.76	6.1	0.08
OR2C3	0.035	0.01	0.026	0.29	0.0076	0.01	0.12	0.49	1.1	0.89
FKSG83	0.010	0.01	0.037	0.22	0.30	0.26	0.61	0.69	2.7	0.31
F2R	73	0.01	54	0.04	55	0.02	29	0.03	15	0.03
DRD2	75	0.01	24	0.10	17	0.02	19	0.04	4.9	0.13
GPR142	0.078	0.60	undetectable	5.E-03	0.51	0.81	1.0	0.99	0.23	0.52
OPRM1	0.57	0.74	0.0028	0.22	0.0063	0.01	0.0032	0.23	0.00050	3.E-03
GPR147	0.059	0.15	0.011	0.29	0.0056	0.01	0.035	0.10	0.00050	5.E-04
GPR62	2.2	0.30	7.3	0.07	14	0.01	10	0.15	3.1	0.08
GPR153	3.3	0.10	8.7	0.21	8.5	0.01	0.50	0.24	3.0	0.04
PPYR1	0.59	0.63	0.033	0.21	0.030	0.01	0.47	0.37	1.2	0.82
EDG8	0.053	0.10	0.080	0.29	0.11	0.01	0.15	0.37	0.50	0.19
GPR160	2.4	0.19	5.9	0.22	12	0.01	1.2	0.90	1.4	0.61
SSTR3	0.40	0.61	0.13	0.49	0.068	0.01	0.72	0.62	0.99	0.99
GPR10	0.15	0.19	0.11	0.38	0.082	0.01	0.23	0.20	0.58	0.36
EDG7	0.42	0.48	0.12	0.56	0.12	0.03	0.0079	0.01	0.032	1.E-03
GRM6	19	0.22	326	0.29	248	0.02	1539	0.01	79	0.01
CCKBR	0.28	0.60	0.12	0.29	0.039	0.03	0.0028	0.01	0.010	0.01
OPRK1	0.29	0.49	1.0	1.0	0.21	0.20	0.0027	0.01	0.046	0.03
CHRM4	19	0.55	5.1	0.23	4.8	0.11	74	0.01	3.3	0.21
OPRD1	11.8	0.29	3.3	0.76	1.9	0.40	344	0.01	0.85	0.88
LGR5	0.50	0.71	0.83	0.95	0.45	0.55	117	0.01	0.22	0.17
GPR123	0.048	0.19	0.034	0.23	0.031	0.02	0.0041	0.15	0.0016	4.E-04
NTSR2	0.023	0.03	0.030	0.23	0.080	0.03	0.0030	0.04	0.0056	5.E-04
TRBV5	0.083	0.14	0.077	0.22	0.10	0.08	2.0	0.79	0.0051	3.E-03
ADORA1	0.83	0.91	0.28	0.32	0.14	0.14	3.0	0.33	0.019	3.E-03
ADRA1A	0.27	0.38	0.066	0.23	0.024	0.03	0.0082	0.19	0.0088	0.01
GRM4	0.13	0.30	0.11	0.32	0.037	0.06	0.0043	0.03	0.0048	0.01
HTR5A	0.074	0.17	0.12	0.29	0.17	0.15	0.0091	0.03	0.017	0.01
GPR84	0.20	0.19	0.39	0.54	0.10	0.05	0.045	0.04	0.043	0.01
GPR39	0.11	0.20	0.0068	0.05	0.015	0.02	0.0041	0.03	0.0058	0.01
GPR77	1.0	0.99	0.47	0.54	0.85	0.85	0.14	0.51	0.041	0.01
GPR37L1	0.049	0.19	0.057	0.22	0.080	0.11	0.0054	0.19	0.0058	0.01
GPR63	1.5	0.77	0.18	0.53	0.075	0.10	1.4	0.82	0.012	0.01
GPR75	0.48	0.43	0.15	0.21	0.22	0.11	0.13	0.06	0.029	0.01
OR2A4	0.51	0.50	5.7	0.22	3.7	0.08	2.1	0.51	3.3	0.01
CD97	4.6	0.12	1.4	0.68	1.8	0.11	1.5	0.67	0.27	0.01

* Fold-change <1 indicates decreased expression compared to normal cerebellum; all fold-change levels rounded to two significant digits. Significant fold-changes (p ≤ 0.01) indicated indicated in bold.

Back to article page

ISSN: 2051-5960

Contact us

Submission enquiries: JJM.Hoozemans@vumc.nl
General enquiries: info@biomedcentral.com